东北农业大学校内基地位于校本部，涵盖学校已批准用于教学、科研、实习的校内用地，总占地面积22公顷，建有园艺实验站、盆栽场、转基因基地、植物表型平台园区、马铃薯研发中心、水产养殖中心、气象站等多个专业场所和设施。

2023年，为进一步规范校内土地资源合理配置和安全有效利用，更好地服务教学、科研等工作，学校决定将原校内基地分属于科技处、后勤处、实验室管理处的管理职责统一划转至实验实习与示范中心，实行“中心、学院”两级管理，负责校内基地的运行管理、条件建设、机耕服务、设施维护、环境治理及日常安全等工作。

校内基地是我校农学、园艺、生物科学等相关专业实践教学基地，也是作物学、园艺学、畜牧学、农业资源与环境、生物学、植物保护、农业工程、水利工程等学科60多个团队的科研场所，是学校一流学科和高水平大学建设的重要支撑。